Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.85e-6■■■■■ 29.6
XRN2Q9H0D6 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 219.68■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 29.6
XRN2Q9H0D6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 29.6
XRN2Q9H0D6 ADAP1-210ENST00000477906 579 ntTSL 315.36■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 29.6
XRN2Q9H0D6 ADAP1-202ENST00000435943 559 ntTSL 515.27■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 29.6
XRN2Q9H0D6 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 29.5
XRN2Q9H0D6 XYLB-202ENST00000424034 3484 ntTSL 28.93□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 29.5
XRN2Q9H0D6 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 515.2■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 29.5
XRN2Q9H0D6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.323e-12■■■■■ 29.5
XRN2Q9H0D6 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.043e-12■■■■■ 29.5
XRN2Q9H0D6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.981e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.874e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 SPIRE2-210ENST00000569108 2409 ntTSL 1 (best)19.01■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 PHF23-204ENST00000570899 649 ntTSL 318.97■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ARHGEF2-217ENST00000497907 764 ntTSL 323.29■■□□□ 1.327e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ARHGEF2-213ENST00000476273 668 ntTSL 316.73■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ARHGEF2-211ENST00000471589 892 ntTSL 513.12□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.397e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 ARHGEF2-214ENST00000477754 883 ntTSL 56.35□□□□□ -1.397e-8■■■■■ 29.4
XRN2Q9H0D6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 29.3
XRN2Q9H0D6 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 29.3
XRN2Q9H0D6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 29.3
XRN2Q9H0D6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 29.3
XRN2Q9H0D6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 29.3
XRN2Q9H0D6 GRK2-209ENST00000530291 324 ntTSL 210.94□□□□□ -0.668e-8■■■■■ 29.3
XRN2Q9H0D6 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 319.52■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 29.3
XRN2Q9H0D6 RIPOR1-207ENST00000562116 244 ntTSL 320.31■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 29.2
XRN2Q9H0D6 RIPOR1-208ENST00000562755 538 ntTSL 420.23■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 29.2
XRN2Q9H0D6 RIPOR1-213ENST00000566522 592 ntTSL 518.38■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 29.2
XRN2Q9H0D6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.371e-11■■■■■ 29.2
XRN2Q9H0D6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.351e-11■■■■■ 29.2
XRN2Q9H0D6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.7■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 29.2
XRN2Q9H0D6 VDAC1-204ENST00000425992 703 ntTSL 328.19■■■□□ 2.19e-9■■■■■ 29.1
XRN2Q9H0D6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.59e-9■■■■■ 29.1
XRN2Q9H0D6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.139e-9■■■■■ 29.1
XRN2Q9H0D6 VDAC1-202ENST00000395044 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 29.1
XRN2Q9H0D6 VDAC1-205ENST00000466080 831 ntTSL 37.21□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 29.1
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XRN2Q9H0D6 GALNT11-206ENST00000431668 626 ntTSL 318.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 29.1
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XRN2Q9H0D6 GALNT11-204ENST00000423337 580 ntTSL 315.9■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 29.1
XRN2Q9H0D6 CDC42-204ENST00000411827 597 ntTSL 320.88■□□□□ 0.933e-9■■■■■ 29.1
XRN2Q9H0D6 IPO4-215ENST00000560935 701 ntTSL 323.77■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 29.1
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XRN2Q9H0D6 MIER2-207ENST00000635755 440 ntTSL 516.15■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 29
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XRN2Q9H0D6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.792e-8■■■■■ 29
XRN2Q9H0D6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 29
XRN2Q9H0D6 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 29
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XRN2Q9H0D6 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-11■■■■■ 29
XRN2Q9H0D6 UBE2J2-213ENST00000471154 336 ntTSL 53.44□□□□□ -1.869e-7■■■■■ 29
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XRN2Q9H0D6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-9■■■■■ 29
XRN2Q9H0D6 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 28.9
XRN2Q9H0D6 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 218.49■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 28.9
XRN2Q9H0D6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 28.9
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XRN2Q9H0D6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 28.9
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XRN2Q9H0D6 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.013e-27■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 EZH2-207ENST00000483012 1491 ntTSL 227.65■■■□□ 2.021e-9■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.952e-9■■■■■ 28.8
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XRN2Q9H0D6 FAM219A-208ENST00000422409 798 ntTSL 225.83■■□□□ 1.735e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.735e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.735e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 EZH2-210ENST00000498186 1876 ntTSL 225.74■■□□□ 1.711e-9■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 ST3GAL6-226ENST00000497008 564 ntTSL 424.15■■□□□ 1.464e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.442e-9■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 ST3GAL6-204ENST00000462152 1102 ntTSL 224.02■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 ST3GAL6-203ENST00000460774 582 ntTSL 322.59■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.184e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 321.97■■□□□ 1.118e-8■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 CLDN15-206ENST00000433833 832 ntTSL 521.93■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.052e-9■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 ST3GAL6-213ENST00000480133 360 ntTSL 421.6■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 YWHAH-205ENST00000471374 1735 ntTSL 221.18■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 ST3GAL6-227ENST00000497621 2109 ntTSL 1 (best)20.44■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 ST3GAL6-219ENST00000489112 804 ntTSL 320.3■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.794e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 28.8
XRN2Q9H0D6 LYPLA2-210ENST00000495365 842 ntTSL 219.18■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 28.8
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