Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPESC1Q9GZL8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPESC1Q9GZL8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms