Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL4Q9C0H6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL4Q9C0H6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms