Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms