Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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FOXQ1Q9C009 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXQ1Q9C009 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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