Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM54Q9BYV2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms