Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PECRQ9BY49 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PECRQ9BY49 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms