Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCAPERQ9BY12 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms