Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM29Q9BSF4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms