Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGRRF1Q99675 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms