Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD9AQ99638 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms