Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms