Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGMNQ99538 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGMNQ99538 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms