Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTCH4Q99466 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTCH4Q99466 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms