Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNKPQ96T60 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms