Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms