Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF12Q96QT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF12Q96QT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms