Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALS2Q96Q42 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALS2Q96Q42 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms