Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN4Q96NY8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms