Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms