Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms