Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFAP53Q96M91 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP53Q96M91 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms