Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC138Q96M89 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC138Q96M89 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms