Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJD4Q96KN9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms