Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPIP1Q96JH7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms