Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS50Q96JG6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms