Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF6Q96J87 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms