Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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