Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMP4Q96G21 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMP4Q96G21 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms