Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC51Q96ER9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC51Q96ER9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC51Q96ER9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC51Q96ER9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC51Q96ER9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC51Q96ER9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC51Q96ER9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms