Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHISA4Q96DD7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA4Q96DD7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms