Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBGCP3Q96CW5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBGCP3Q96CW5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms