Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLP1Q92989 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLP1Q92989 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLP1Q92989 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms