Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC4Q92889 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC4Q92889 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC4Q92889 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC4Q92889 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC4Q92889 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC4Q92889 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms