Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSC1Q92574 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC1Q92574 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms