Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms