Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SELENOMQ8WWX9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SELENOMQ8WWX9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms