Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CKAP2Q8WWK9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP2Q8WWK9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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