Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD2

SP7, Transcription factor Sp7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP7Q8TDD2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP7Q8TDD2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP7Q8TDD2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP7Q8TDD2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms