Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA18Q8TC71 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA18Q8TC71 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms