Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG8Q8ND04 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms