Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00301Q8NCQ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms