Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD1Q8NBU5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD1Q8NBU5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD1Q8NBU5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD1Q8NBU5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD1Q8NBU5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD1Q8NBU5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD1Q8NBU5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD1Q8NBU5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms