Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPC24Q8NBT2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms