Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX3Q8N9I9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms