Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBL4BQ8N7F7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms