Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms