Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00269Q8N2A0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00269Q8N2A0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms