Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1F7

NUP93, Nuclear pore complex protein Nup93, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP93Q8N1F7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP93Q8N1F7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP93Q8N1F7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms