Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC2Q8N158 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC2Q8N158 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms